tf-operator源码分析

2021/08/18 5 分钟阅读

简介

简介
从kube-flow说起
案例
源码分析
- reconcilePods
- reconcileServices
Running jobs with gang-scheduling
kubeflow/commmon

从kube-flow说起

炼丹师的工程修养之五：KubeFlow介绍和源码分析

KubeFlow不是什么

KubeFlow不是机器学习框架，跟TensorFlow，PyTorch，XGBoost不是一个层次的东西
KubeFlow不负责调度，他还是要依赖K8S来调度，但是可以在KubeFlow这个层次上，使用K8S提供的机制针对机器学习来调整资源调度的策略和算法
KubeFlow不是一个软件，他更像是一个技术栈，用户从这个技术栈中挑选符合需求的组件使用，各个组件是非常松耦合的
KubeFlow不是机器学习算法，这个不解释了

kubeflow 也在不断发展，Kubeflow Training Operator 统一云上 AI 训练。阿里推出类似 kube-flow 的 KubeDL 加入 CNCF Sandbox，加速 AI 产业云原生化

Kubeflow 支持两种不同的 Tensorflow 框架分布式训练方法。

Tensorflow 架构/ PS 模式，它依赖于集中式参数服务器来实现工作线程之间的协调。
分散式方法/mpi allreduce 模式，工作线程通过 MPI AllReduce 原语直接相互通信，不使用参数服务器。NVIDIA 的 NCCL 库已经在GPU 上有效地执行了大部分 MPI 原语，而 Uber 的Horovod 让使用 TensorFlow 执行多 GPU 和多节点训练变得轻而易举。与参数服务器相比，第二种方法可以更好地优化带宽和更好地扩展。

蚂蚁开源大规模智能分布式训练系统我们希望设计并实现一个系统，让用户完全摆脱资源配置的束缚，专注于模型训练本身。在没有任何资源配置输入的情况下，DLRover 仍然可以为每个训练作业提供最佳资源配置。考虑到用户可能会以不同的方式运行他们的训练作业，DLRover 除了面向训练平台进行作业统一管理的 Cluster Mode，也提供 Single-Job Mode 方便独立的算法开发者也能享受到弹性容错等基本特性。

案例

官方文档 TensorFlow Training (TFJob)

apiVersion: kubeflow.org/v1
kind: TFJob
metadata:
  generateName: tfjob
  namespace: kubeflow
spec:
  tfReplicaSpecs:
    PS:
      replicas: 1
      restartPolicy: OnFailure
      template:
        spec:
          containers:
          - name: tensorflow
            image: gcr.io/your-project/your-image
            command:
              - python
              - -m
              - trainer.task
              - --batch_size=32
              - --training_steps=1000
    Worker:
      replicas: 3
      restartPolicy: OnFailure
      template:
        spec:
          containers:
          - name: tensorflow
            image: gcr.io/your-project/your-image
            command:
              - python
              - -m
              - trainer.task
              - --batch_size=32
              - --training_steps=1000

vivo AI 计算平台弹性分布式训练的探索和实践

syncTFJob 是 tf-operator 管理对象的核心逻辑实现，内部对不同 ReplicaType 的 Pod 进行检查并推导出任务状态，逻辑流程图如下：

源码分析

2020.9.23 实现crd 有两派思路，tf-operator 都有体现：

tf-operator.v1 是目前在用的版本，基于 informer 和 client 裸写的。
training-operator.v1 是下一个大版本的设计，还不太稳定，没有发布出去。training-operator.v1 是基于 controller-runtime 写的，当然都有大量的复用部分，因此抽了一个 github.com/kubeflow/commmon。kubeflow/commmon 不仅用于tf-operator 自身的迭代，也用于整合其它机器学习framework的operator。

对于机器学习任务来说，一般都是运行多个进程，ps/master 进程负责协调，worker 进程负责干活儿，所有进程运行同一段代码，相互之间互相访问，并共享一些全局信息，所以整体上各个operator（tf/pytorch/mpi 等）都是很像的。

以下分析以老版 tf-operator.v1 为主。

// pkg/controller.v1/common/job_controller.go
type JobController struct {
    WorkQueue workqueue.RateLimitingInterface
}
// pkg/controller.v1/common/job.go
func (jc *JobController) ReconcileJobs(...){...}
// pkg/controller.v1/common/pod.go
// AddPod/UpdatePod/DeletePod 会作为pod event 的回调，从pod 从获取 resolveControllerRef 并将对应的tf job 加入workqueue
func (jc *JobController) AddPod(obj interface{}) {...}
func (jc *JobController) UpdatePod(old, cur interface{}) {...}
func (jc *JobController) DeletePod(obj interface{}) {...}
func (jc *JobController) ReconcilePods(...){...}
// pkg/controller.v1/common/service.go

pod/service/tfjob 的变化都会转换 jobname 加入到WorkQueue 触发reconcileTFJobs

// pkg/controller.v1/tensorflow/controller.go
func (tc *TFController) processNextWorkItem() bool {
	...
	// 这个Handler其实是SyncTFJob这个函数
	forget, err := tc.syncHandler(key)
    ...
}
func (tc *TFController) syncTFJob(key string) (bool, error) {
	...
 	// 调用reconcileTFJobs这个函数来“启动”TFJobs
	reconcileTFJobsErr = tc.reconcileTFJobs(tfjob)
	...
}
// pkg/controller.v1/common/job.go
func (jc *JobController) ReconcileJobs(...)error{
    pods, err := jc.Controller.GetPodsForJob(job)
    services, err := jc.Controller.GetServicesForJob(job)
    // If the Job is succeed or failed, delete all pods and services.
    // If the Job exceeds backoff limit or is past active deadline delete all pods and services, then set the status to failed
    // 正常 Reconcile 逻辑
    if jc.Config.EnableGangScheduling {
        _, err := jc.SyncPodGroup(metaObject, pgSpec)
    }
    // Diff current active pods/services with replicas.
    for rtype, spec := range replicas {
        err := jc.Controller.ReconcilePods(metaObject, &jobStatus, pods, rtype, spec, replicas)
        err = jc.Controller.ReconcileServices(metaObject, services, rtype, spec)
    }
    // 如果状态变更了就更新到apiserver
}

reconcilePods

Kubeflow实战系列: 利用TFJob运行分布式TensorFlow TFJob 的核心是构建ClusterSpec。

{
  "cluster":{
    "chief":[],   
    "ps":[],
    "worker":[]
  }
}

tf_operator的工作就是创建对应的Pod, 并且将环境变量TF_CONFIG传入到每个Pod中，TF_CONFIG包含三部分的内容，当前集群ClusterSpec，该节点的角色类型，以及id。

// pkg/controller.v1/tensorflow/pod.go
func (tc *TFController) reconcilePods(...) {
	...
    // 调用createNewPod函数创建Pod
	err = tc.createNewPod(tfjob, rt, strconv.Itoa(index), spec, masterRole)
	...
}

func (tc *TFController) createNewPod(...) error {
	...
	// 生成集群的配置信息，这里最关键，看一下实现
	setClusterSpec(podTemplate, tfjob, rt, index)
    if tc.Config.EnableGangScheduling {... podTemplate.Spec.SchedulerName = gangSchedulerName ...}
	// 使用上面的配置信息，真正启动Pod的创建
	tc.PodControl.CreatePodsWithControllerRef(tfjob.Namespace, podTemplate, tfjob, controllerRef)
	...
}

func setClusterSpec(podTemplateSpec *v1.PodTemplateSpec, tfjob *tfv1.TFJob, rt, index string) error { 
	...
	// 有没有看到熟悉的字眼：这里生成了TF_CONFIG的Json串
	tfConfigStr, err := genTFConfigJSONStr(tfjob, rt, index)
	
	// 接着把TF_CONFIG作为Env环境变量，在启动时传递给容器
	for i := range podTemplateSpec.Spec.Containers {
		if podTemplateSpec.Spec.Containers[i].Name == tfv1.DefaultContainerName {
			podTemplateSpec.Spec.Containers[i].Env = append(podTemplateSpec.Spec.Containers[i].Env, v1.EnvVar{
				Name:  tfConfig, // tfConfig == “TF_CONFIG”
				Value: tfConfigStr,
			})
			break
		}
	}
	...
}
// TF_CONFIG的生成过程，很直接
func genTFConfigJSONStr(tfjob *tfv1.TFJob, rtype, index string) (string, error) {
	i, err := strconv.ParseInt(index, 0, 32)
	cluster, err := genClusterSpec(tfjob)
    // 组装形成TF_CONFIG
	tfConfig := TFConfig{
		Cluster: cluster,
		Task: TaskSpec{
			Type:  rtype,
			Index: int(i),
		},
		Environment: "cloud",
	}
}

func genClusterSpec(tfjob *tfv1.TFJob) (ClusterSpec, error) {
	...
		// 这里循环生成了TF_CONFIG里面的Cluster信息。注意看注释，使用DNS配合Service，解决的还是各个节点IP不固定的问题
		for i := int32(0); i < *spec.Replicas; i++ {
			// As described here: https://kubernetes.io/docs/concepts/services-networking/dns-pod-service/#a-records.
			// Headless service assigned a DNS A record for a name of the form "my-svc.my-namespace.svc.cluster.local".
			// And the last part "svc.cluster.local" is called cluster domain
			// which maybe different between kubernetes clusters.
			hostName := jobcontroller.GenGeneralName(tfjob.Name, rt, fmt.Sprintf("%d", i))
			svcName := hostName + "." + tfjob.Namespace + "." + "svc"
			cluserDomain := os.Getenv(EnvCustomClusterDomain)
			if len(cluserDomain) > 0 {
				svcName += "." + cluserDomain
			}

			endpoint := fmt.Sprintf("%s:%d", svcName, port)
			replicaNames = append(replicaNames, endpoint)
		}
        // rt是角色，比如worker， ps等
		clusterSpec[rt] = replicaNames
	...
}

reconcileServices

// pkg/controller.v1/tensorflow/service.go
func (tc *TFController) reconcileServices(...) {
	...
	// 循环创建多个Service
	serviceSlices := tc.GetServiceSlices(services, replicas, tflogger.LoggerForReplica(tfjob, rt))
	for index, serviceSlice := range serviceSlices {
		if len(serviceSlice) > 1 {
			...
		} else if len(serviceSlice) == 0 {
			tflogger.LoggerForReplica(tfjob, rt).Infof("need to create new service: %s-%d", rt, index)
			// 调用createNewService创建Service
			err = tc.createNewService(tfjob, rtype, strconv.Itoa(index), spec)
		}
	}
	...
}

func (tc *TFController) createNewService(...) {
	...
	// 这里就直接生成了Service的配置信息。注意Selector
	service := &v1.Service{
		Spec: v1.ServiceSpec{
			ClusterIP: "None",
			Selector:  labels,
			Ports: []v1.ServicePort{
				{
					Name: tfv1.DefaultPortName,
					Port: port,
				},
			},
		},
	}
    // Service的名字
	service.Name = jobcontroller.GenGeneralName(tfjob.Name, rt, index)
	service.Labels = labels
    // 调用后面的接口创建Service
	err = tc.ServiceControl.CreateServicesWithControllerRef(tfjob.Namespace, service, tfjob, controllerRef)
}

Running jobs with gang-scheduling

Take tf-operator for example, enable gang-scheduling in tf-operator by setting true to --enable-gang-scheduling flag. Volcano scheduler and operator in Kubeflow achieve gang-scheduling by using PodGroup. operator will create the PodGroup of the job automatically. operator 会创建PodGroup，Volcano scheduler 会根据PodGroup 实现gang-scheduling，TFJob yaml 本身无区别。

老版tf-operator 使用kube-batch，新版使用Volcano

kubeflow/commmon

以tf-operator/pytorch-operator/mpi-operator 为例，一开始是独立发展，有对应的tfjob/pytorchjob/mpijob，但有许多共通之处

xxjob 在runPolicy上有共通的性质，比如gang-schdueler 所需的 SchedulerPolicy ，都包含ReplicaSpec，需要用JobStatus 描述状态
xxjob 在Reconcile 上有共通的逻辑，为xxjob 创建对应的pod 和service（为pod 之间互通），并根据pod 运行状态更新xxjob 状态

github.com/kubeflow/common
	/pkg
		/apis/common/v1
			/types.go		// 定义了 RunPolicy 等struct
			/interface.go 	// 定义了 ControllerInterface
	/controller.v1
		/common
			/job_controller.go  // 定义了 JobController struct

所以kubeflow/common 定义了RunPolicy 等struct作为xxjob 的成员

type ControllerInterface interface {
	// Get 方法
	ControllerName() string
	GetJobFromInformerCache(namespace, name string) (metav1.Object, error)
	GetJobFromAPIClient(namespace, name string) (metav1.Object, error)
	GetPodsForJob(job interface{}) ([]*v1.Pod, error)
	GetServicesForJob(job interface{}) ([]*v1.Service, error)
	// Reconcile 方法
	ReconcileJobs(job interface{}, replicas map[ReplicaType]*ReplicaSpec, jobStatus JobStatus, runPolicy *RunPolicy) error
	ReconcilePods(job interface{}, jobStatus *JobStatus, pods []*v1.Pod, rtype ReplicaType, spec *ReplicaSpec,
		replicas map[ReplicaType]*ReplicaSpec) error
	ReconcileServices(job metav1.Object, services []*v1.Service, rtype ReplicaType, spec *ReplicaSpec) error
}
type JobController struct {
	Controller apiv1.ControllerInterface
	...
}
// github.com/kubeflow/common/pkg/controller.v1/common/job.go
func (jc *JobController) ReconcileJobs(job interface{}, replicas map[ReplicaType]*ReplicaSpec, jobStatus JobStatus, runPolicy *RunPolicy)error{}
// github.com/kubeflow/common/pkg/controller.v1/common/job_controller.go
func (jc *JobController) SyncPodGroup(job metav1.Object, pgSpec v1beta1.PodGroupSpec) (*v1beta1.PodGroup, error) {...}

kubeflow/common 定义了 JobController，JobController.ReconcileJobs 是 Reconcile 逻辑的入口：为xxjob 创建对应的pod 和service（为pod 之间互通），并根据pod 运行状态更新xxjob 状态。这个过程中要获取 job/pod/service 的信息，要Reconcile Pods/Services。

func (jc *JobController) ReconcileJobs(job interface{},...,jobStatus apiv1.JobStatus,runPolicy *apiv1.RunPolicy){
	pods, err := jc.Controller.GetPodsForJob(job)
	services, err := jc.Controller.GetServicesForJob(job)
	// 如果已经成功或失败
	if commonutil.IsSucceeded(jobStatus) || commonutil.IsFailed(jobStatus) {
		...
	}
	// 如果超出limit
	if jobExceedsLimit {

	}else{	
		if jc.Config.EnableGangScheduling {

		}
		for rtype, spec := range replicas {
			err := jc.Controller.ReconcilePods(metaObject, &jobStatus, pods, rtype, spec, replicas)
			err = jc.Controller.ReconcileServices(metaObject, services, rtype, spec)
		}
	}
	err = jc.Controller.UpdateJobStatus(job, replicas, &jobStatus)
	return nil
}

JobController 类似模板类，实现了核心逻辑，又要留有足够的扩展性

TFJobReconciler 聚合了 JobController，这样可以使用 JobController.ReconcileJobs 触发Reconcile 核心逻辑
TFJobReconciler 又实现了ControllerInterface ，JobController 通过 ControllerInterface 实现聚合TFJobReconciler 的效果，可以调用Get 方法获取信息，也可以调用 ReconcileXX 方法执行上层自定义扩展逻辑。

// github.com/kubeflow/tf-operator/pkg/controller.v1/tensorflow/tfjob_controller.go
type TFJobReconciler struct {
	common.JobController
	client.Client
	Scheme   *runtime.Scheme
	...
}
func (r *TFJobReconciler) Reconcile(ctx context.Context, req ctrl.Request) (ctrl.Result, error) {
	tfjob := &kubeflowv1.TFJob{}
	err := r.Get(ctx, req.NamespacedName, tfjob)
	needReconcile := util.SatisfiedExpectations(r.Expectations, jobKey, replicaTypes)
	err = r.ReconcileJobs(tfjob, tfjob.Spec.TFReplicaSpecs, tfjob.Status, &tfjob.Spec.RunPolicy)
	return ctrl.Result{}, nil
}

李乾坤

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